1）免疫调节与自身免疫性疾病的基础与临床研究：基于对Th17、Treg和Tfh在自身免疫性甲状腺疾病、类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮和病毒性心肌炎等自身免疫性疾病的发病机制中作用的深入研究，阐明参与免疫调节的细胞、基因、分子和miRNA等非编码RNA，为自身免疫性疾病的诊治提供新的方法和依据。    2）单克隆抗体制备与基因工程抗体研究：基于单抗和基因工程抗体技术，主要研制针对各类免疫细胞及调节免疫应答过程的关键性因子的单克隆抗体和基因工程抗体；各类病原体及其代谢产物的单克隆抗体。应用研制的单抗应用于各类免疫疾病的发病机制和诊断，各类病原体的致病机制和诊断，并为研发临床免疫诊断新技术和新诊断试剂奠定基础。利用抗体工程研发的人源化单抗、单链抗体和双特异单抗应用于免疫或感染性疾病的诊断和治疗。 3）胸腺退化机制和T细胞免疫耐受的诱导研究：通过阐明胸腺退化的机制和T细胞中枢和外周免疫耐受机制。在此基础上结合免疫耐受诱导技术，推进抗移植排斥反应研究，为T细胞的重建奠定基础。制备移植排斥反应中重要分子的单克隆抗体，为临床移植排斥反应的监控提供技术支撑，推动江苏乃至全国临床器官移植工作的开展。